"Ich hätte gerne als Co-Trainer der Profimannschaft weitergearbeitet. Da das nicht möglich ist, habe ich mich entschlossen, die Schanzer zu verlassen. Wir gehen im guten Verhältnis auseinander", wird der der 60-Jährige in einer offiziellen Mitteilung des Klubs zitiert. Der FCI begründete die Trennung mit der Umstruktierung im Klub, der zuletzt seinen ehemaligen Profi Andre Mijatovic ins Trainerteam geholt hatte: "Nachdem sich der Verein nach der Installation von Angelo Vier als neuem Sportdirektor und Stefan Leitl als neuem Cheftrainer für eine Umstrukturierung entschieden hat, konnte mit Michael Henke leider keine Einigung hinsichtlich eines neuen Aufgabenbereichs gefunden werden."

Henke war seit 2013 beim FCI tätig. Seine größten Erfolge feierte er einst als Assistent von Ottmar Hitzfeld bei Borussia Dortmund und Bayern München. Als Cheftrainer arbeitete er lediglich beim 1. FC Kaiserslautern, wo er aber 2005 nach nur wenigen Monaten entlassen wurde.